Στόχος του οργανισμού είναι η καλύτερη λειτουργία, ο εκσυγχρονισμός και η ανάπτυξη των Κεντρικών Αγορών Αθήνας, Πάτρας και των Ιχθυοσκαλών της χώρας, σύμφωνα με τα διεθνή πρότυπα. Ο Αντιπεριφερειάρχης στην συζήτηση που είχε με τον κ. Αποστολάκο εξέφρασε την ικανοποίησή του για την συνεχή βελτίωση των παρεχόμενων υπηρεσιών με όρους ποιότητας και προσβασιμότητας, με γνώμονα την καλύτερη εξυπηρέτηση των καταναλωτών και την ανάπτυξη συνθηκών υγιούς ανταγωνισμού και πρόσθεσε: «Είναι σημαντικό να φιλοξενούνται και τοπικές επιχειρήσεις εμπορίου οπωροκηπευτικών, κρεάτων, προϊόντων αλιείας και γενικότερα τροφίμων, νωπών ή μεταποιημένων προϊόντων σε αυτές τις αγορές. Ο πρωτογενής τομέας της Περιφέρειάς μας στηρίζεται σε δυναμικές επιχειρήσεις του αγροδιατροφικού τομέα που συμμετέχουν σε τέτοια εξελισσόμενα συνεργατικά σχήματα.».